singscore

DOI:10.18129 / B9.bioc.singscore

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见singscore．

基于排名的单样本基因集评分方法

Bioconductor版本:3.9

一种简单的单样本基因签名评分方法，使用基于排名的统计分析样本的基因表达谱。它在单样本水平上对基因集的表达活性进行评分。

作者:Ruqian Lyu [aut, ctb]， Momeneh Foroutan [aut, ctb]， Dharmesh D. Bhuva [aut, cre]

维护者:Dharmesh D. Bhuva < Bhuva。D在wehi.edu.au>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("singscore")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“singscore”)

超文本标记语言	R脚本	1.微分共表达分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneSetEnrichment，软件
版本	1.4.0
在Bioconductor公司	BioC 3.7 (R-3.5)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5)，GSEABase
进口	方法，统计，图形，ggplot2grDevices,ggrepel，情节，tidyr，plyr，magrittr，重塑，刨边机，RColorBrewer，Biobase，BiocParallel，SummarizedExperiment，matrixStats，reshape2，S4Vectors
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://davislaboratory.github.io/singscore
BugReports	https://github.com/DavisLaboratory/singscore/issues
全靠我
进口我	SingscoreAMLMutations
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	singscore_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	singscore_1.4.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	singscore_1.4.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singscore
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/singscore
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/singscore/
软件包下载报告	下载数据