该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅seqpattern。
生物导体版本:3.9
可视化寡核苷酸模式和序列基序在一个以公共参考点为中心的大型序列中出现,并按用户定义的特征进行排序。
作者:vanja haberle
维护者:vanja haberle
引用(从r内,输入引用(“ seqpattern”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ seqpattern”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ seqpattern”)
R脚本 | seqpattern | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(4。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | 方法,R(> = 2.15.0) |
进口 | 生物弦,,,,基因组机,,,,iranges,,,,克恩斯门茶,,,,plotrix |
链接 | |
建议 | BSGENOME.DRERIO.UCSC.DANRER7,,,,卡格,,,,运行,,,,生物基因,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | 平行 |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 基因组化 |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | seqpattern_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | seqpattern_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | seqpattern_1.16.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqpattern |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqpattern |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqpattern/ |
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