seqpattern

doi:10.18129/b9.bioc.seqpattern

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅seqpattern

可视化一组排序序列的寡核苷酸模式和基序发生

生物导体版本:3.9

可视化寡核苷酸模式和序列基序在一个以公共参考点为中心的大型序列中出现,并按用户定义的特征进行排序。

作者:vanja haberle

维护者:vanja haberle

引用(从r内,输入引用(“ seqpattern”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ seqpattern”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ seqpattern”)

PDF R脚本 seqpattern
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(4。5年)
执照 GPL-3
要看 方法,R(> = 2.15.0)
进口 生物弦,,,,基因组机,,,,iranges,,,,克恩斯门茶,,,,plotrix
链接
建议 BSGENOME.DRERIO.UCSC.DANRER7,,,,卡格,,,,运行,,,,生物基因,,,,生物使用
系统要求
增强 平行
URL
取决于我
进口我 基因组化
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 seqpattern_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 seqpattern_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) seqpattern_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqpattern
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqpattern
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/seqpattern/
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