半条

doi:10.18129/b9.bioc.semisup

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅半条

半监督混合物模型

生物导体版本:3.9

用于检测具有对定量性状的交互作用的SNP。该r套件从测试交互项中移开,并朝着测试单个SNP是否参与任何交互作用的转移。这将多个测试负担减少到每个SNP的一个测试,并允许与未观察到的因素进行相互作用。一次分析一个SNP,根据小等位基因的数量将个体分为两组。如果两组之间的定量性状在平均值上有所不同,则SNP具有主要效果。如果定量性状在一个组和所有其他个体中的某些个体之间的分布之间有所不同,则可能具有互动效果。隐含的成员资格概率可能表明潜在的交互变量。

作者:Armin Rauschenberger [AUT,CRE]

维护者:Armin Rauschenberger

引用(从r内,输入引用(“半up”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ semiSup”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“半完”)

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文本 消息

细节

生物浏览 分类,,,,聚类,,,,dnaseq,,,,遗传学,,,,基因组变量,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,SNP,,,,软件,,,,somaticmmut
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.5.0)
进口 VGAM
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,总结性特征
系统要求
增强
URL https://github.com/rauschenberger/semisup
BugReports https://github.com/rauschenberger/semisup/issues
取决于我
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包装档案

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源包 semisup_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 semisup_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) semisup_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/semisup
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/半up
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/semisup/
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