scsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.scsR

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scsR

SiRNA校正种子脱靶效应介导的

Bioconductor版本:3.9

纠正了全基因组siRNA屏幕种子脱靶效应介导的。合适的函数来确定有效的种子/ microrna并可视化效果也提供的包。

作者:安德里亚•弗兰切斯基尼

维护人员:安德里亚•弗兰切斯基尼< andrea.franceschini isb-sib。ch >,罗杰Meier <罗杰。在lmsc.ethz迈耶。ch >,基督教冯仅仅<仅仅在imls.uzh.ch >

从内部引用(R,回车引用(“scsR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scsR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“scsR”)

PDF R脚本 scsR装饰图案
PDF 参考手册

细节

biocViews 预处理,软件
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 2.14 (r - 3.1)(5.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 2.14.0),STRINGdb、方法、BiocGenerics,Biostrings,IRanges,plyr,tcltk
进口 sqldf,哈希,ggplot2、图形、grDevicesRColorBrewer
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 scsR_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 scsR_1.20.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) scsR_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scsR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scsR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/scsR/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
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