这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scsR。
Bioconductor版本:3.9
纠正了全基因组siRNA屏幕种子脱靶效应介导的。合适的函数来确定有效的种子/ microrna并可视化效果也提供的包。
作者:安德里亚•弗兰切斯基尼
维护人员:安德里亚•弗兰切斯基尼< andrea.franceschini isb-sib。ch >,罗杰Meier <罗杰。在lmsc.ethz迈耶。ch >,基督教冯仅仅<仅仅在imls.uzh.ch >
从内部引用(R,回车引用(“scsR”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scsR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“scsR”)
R脚本 | scsR装饰图案 | |
参考手册 |
biocViews | 预处理,软件 |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(5.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 2.14.0),STRINGdb、方法、BiocGenerics,Biostrings,IRanges,plyr,tcltk |
进口 | sqldf,哈希,ggplot2、图形、grDevicesRColorBrewer |
链接 | |
建议 | RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | scsR_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | scsR_1.20.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | scsR_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scsR |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scsR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/scsR/ |
包下载报告 | 下载数据 |