Scoreinvhap
doi：10.18129/b9.bioc.scoreinvhap
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅Scoreinvhap。
获得预定义区域的反转状态
生物导体版本：3.9
ScoreInvHap可以获得已知反转的样本倒置状态。ScoreInVHAP使用SNP数据作为输入，并需要有关反转的以下信息：不同单倍型中的基因型频率，区域SNP和反转状态之间的R2和参考中的杂合子基因型。该软件包包括两个众所周知的倒置（8p23和17q21.31）和其他两个区域的数据。
作者：Carlos Ruiz [AUT，CRE]，Juan R. Gonzalez [AUT]
维护者：carlos ruiz
引用（从r内，输入引用（“ Scoreinvhap”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ scoreinvhap”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ ScoreInvhap”）
| html | R脚本 | 使用ScoreInvHap调用单倍型反转 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 遗传学，，，，基因组变量，，，，SNP，，，，软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（2年） |
| 执照 | 文件许可证 |
| 要看 | R（> = 3.4.0） |
| 进口 | 生物弦， 方法，snpstats，，，，变体，，，，基因组机，，，，生物比较，图形，总结性特征 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，生物使用，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | scoreinvhap_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | scoreinvhap_1.6.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | ScoreInvhap_1.6.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scoreinvhap |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/scoreinvhap |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/scoreinvhap/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
