此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见rsbml.
Bioconductor版本:3.9
将R链接到libsbml进行SBML解析,验证输出,提供S4 SBML DOM,将SBML转换为R图对象。可选链接到SBML ODE求解器库(SOSLib),用于模拟模型。
作者:Michael Lawrence
维护者:Michael Lawrence
引用(从R中,输入引用(“rsbml”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“rsbml”)
R脚本 | 快速启动rsbml | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 安装 |
biocViews | GraphAndNetwork,网络,通路,软件 |
版本 | 2.42.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.1 (R-2.6)(12年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.6.0),BiocGenerics(>= 0.3.2),方法,utils |
进口 | BiocGenerics,图,跑龙套 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | libsbml (= = 5.10.2) |
增强了 | |
URL | http://www.sbml.org |
取决于我 | BiGGR |
进口我 | |
建议我 | 钢琴,SBMLR |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | rsbml_2.42.0.tar.gz |
Windows二进制 | rsbml_2.42.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | rsbml_2.42.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rsbml |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rsbml |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rsbml/ |
包下载报告 | 下载数据 |