rsbml

DOI:10.18129 / B9.bioc.rsbml

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见rsbml

R对SBML的支持,使用libsbml

Bioconductor版本:3.9

将R链接到libsbml进行SBML解析,验证输出,提供S4 SBML DOM,将SBML转换为R图对象。可选链接到SBML ODE求解器库(SOSLib),用于模拟模型。

作者:Michael Lawrence

维护者:Michael Lawrence

引用(从R中,输入引用(“rsbml”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“rsbml”)

PDF R脚本 快速启动rsbml
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 安装

细节

biocViews GraphAndNetwork网络通路软件
版本 2.42.0
Bioconductor自 BioC 2.1 (R-2.6)(12年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.6.0),BiocGenerics(>= 0.3.2),方法,utils
进口 BiocGenerics,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements libsbml (= = 5.10.2)
增强了
URL http://www.sbml.org
取决于我 BiGGR
进口我
建议我 钢琴SBMLR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 rsbml_2.42.0.tar.gz
Windows二进制 rsbml_2.42.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) rsbml_2.42.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rsbml
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rsbml
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rsbml/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网