咆哮
DOI:10.18129 / B9.bioc.roar
这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见咆哮．
从RNA-seq比对中鉴别APA的使用差异
Bioconductor版本:3.9
确定APA位点的优先使用，比较两种生物学条件，从已知的替代位点和从标准RNA-seq实验中获得的比对开始。
作者:Elena Grassi
维护者:Elena Grassi < Grassi。E在gmail.com>
引文(从R内，输入引用(“咆哮”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("roar")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“咆哮”)
| R脚本 | 从RNA-seq比对中鉴别APA的使用差异 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | HighThroughputSequencing，RNAseq，测序，软件，转录 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(5.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.0.1) |
| 进口 | 方法,BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，SummarizedExperiment，GenomicAlignments(> = 0.99.4),rtracklayer，GenomeInfoDb |
| 链接 | |
| 建议 | RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14，testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/vodkatad/roar/ |
| 全靠我 | |
| 进口我 | XBSeq |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | roar_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | roar_1.20.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | roar_1.20.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/roar |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/roar |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/roar/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
