RHDF5

doi:10.18129/b9.bioc.rhdf5

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅RHDF5

R接口到HDF5

生物导体版本:3.9

该软件包在HDF5和R. HDF5的主要功能之间提供了一个接口,是能够通过完全便携式文件格式存储和/或复杂的数据集以及大量存储(磁盘)上的各种元数据。因此,RHDF5软件包适用于R和其他软件包之间的大型和/或复杂数据集的交换,以及让R应用程序在大于可用RAM的数据集上工作。

作者:Bernd Fischer [AUT],Gregoire Pau [AUT],Mike Smith [AUT,CRE],Martin Morgan [CTB],Daniel Van Twisk [CTB]

维护者:迈克·史密斯(Mike Smith)

引用(从r内,输入引用(“ RHDF5”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rhdf5”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ RHDF5”)

html R脚本 RHDF5
html R脚本 RHDF5实用提示
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,基础设施,,,,软件
版本 2.28.1
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 14。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.5.0),方法
进口 Rhdf5lib(> = 1.3.2)
链接 Rhdf5lib
建议 位64,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,微实验,,,,dplyr,,,,GGPLOT2
系统要求 gnu做
增强
URL https://github.com/grimbough/rhdf5
BugReports https://github.com/grimbough/rhdf5/issues
取决于我 Genogam,,,,GSCA,,,,HDF5Array,,,,打ic,,,,loomexpermiment
进口我 BGEECALL,,,,生物形式,,,,BSSEQ,,,,COGAPS,,,,CTRAP,,,,Diffhic,,,,dmelsgi,,,,doqtl,,,,液滴,,,,EventPointer,,,,gep2pep,,,,H5VC,,,,电离,,,,MOFA,,,,phantasus,,,,属属,,,,烤饼,,,,紧身
建议我 EDGER,,,,激流回旋,,,,总结性特征,,,,tximport
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rhdf5_2.28.1.tar.gz
Windows二进制 rhdf5_2.28.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) rhdf5_2.28.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhdf5
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rhdf5
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rhdf5/
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