该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅RHDF5。
生物导体版本:3.9
该软件包在HDF5和R. HDF5的主要功能之间提供了一个接口,是能够通过完全便携式文件格式存储和/或复杂的数据集以及大量存储(磁盘)上的各种元数据。因此,RHDF5软件包适用于R和其他软件包之间的大型和/或复杂数据集的交换,以及让R应用程序在大于可用RAM的数据集上工作。
作者:Bernd Fischer [AUT],Gregoire Pau [AUT],Mike Smith [AUT,CRE],Martin Morgan [CTB],Daniel Van Twisk [CTB]
维护者:迈克·史密斯(Mike Smith)
引用(从r内,输入引用(“ RHDF5”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rhdf5”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ RHDF5”)
html | R脚本 | RHDF5 |
html | R脚本 | RHDF5实用提示 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 2.28.1 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 14。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.5.0),方法 |
进口 | Rhdf5lib(> = 1.3.2) |
链接 | Rhdf5lib |
建议 | 位64,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,微实验,,,,dplyr,,,,GGPLOT2 |
系统要求 | gnu做 |
增强 | |
URL | https://github.com/grimbough/rhdf5 |
BugReports | https://github.com/grimbough/rhdf5/issues |
取决于我 | Genogam,,,,GSCA,,,,HDF5Array,,,,打ic,,,,loomexpermiment |
进口我 | BGEECALL,,,,生物形式,,,,BSSEQ,,,,COGAPS,,,,CTRAP,,,,Diffhic,,,,dmelsgi,,,,doqtl,,,,液滴,,,,EventPointer,,,,gep2pep,,,,H5VC,,,,电离,,,,MOFA,,,,phantasus,,,,属属,,,,烤饼,,,,紧身 |
建议我 | EDGER,,,,激流回旋,,,,总结性特征,,,,tximport |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rhdf5_2.28.1.tar.gz |
Windows二进制 | rhdf5_2.28.1.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | rhdf5_2.28.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhdf5 |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rhdf5 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rhdf5/ |
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