restfulSE

DOI:10.18129 / B9.bioc.restfulSE

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅restfulSE。

访问矩阵像HDF5服务器内容或BigQuery内容通过SummarizedExperiment接口

Bioconductor版本:3.9

这个包提供了函数和类与远程数据存储接口通过SummarizedExperiment-like对象进行操作。

作者:文森特•凯里(aut)什维塔Gopaulakrishnan (cre, aut)

维护人员:什维塔Gopaulakrishnan < reshg channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“restfulSE”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“restfulSE”)

PDF	R脚本	远程HDF5 restfulSE用SE -实验界面
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道,基础设施,测序,SingleCell,软件,转录组
版本	1.6.1
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6),SummarizedExperiment,DelayedArray
进口	跑龙套、属性、方法S4Vectors,Biobase,reshape2,AnnotationDbi,DBI,GO.db,rhdf5client,dplyr(> =是0.7.1),magrittr,bigrquery,ExperimentHub,AnnotationHub,rlang
链接
建议	knitr,testthat,Rtsne,org.Mm.eg.db,org.Hs.eg.db,BiocStyle,restfulSEData
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	tenXplore
进口我
建议我	BiocOncoTK,BiocSklearn
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	restfulSE_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	restfulSE_1.6.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	restfulSE_1.6.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/restfulSE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ restfulSE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/restfulSE/
包下载报告	下载数据