rTRM

DOI:10.18129 / B9.bioc.rTRM

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见rTRM．

从PPI网络中鉴定转录调节模块

Bioconductor版本:3.9

rTRM识别蛋白质-蛋白质相互作用网络中的转录调节模块(TRMs)。

作者:Diego Diez

维护者:Diego Diez

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("rTRM")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rTRM”)

PDF	R脚本	rTRM介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation，GraphAndNetwork，网络，软件，转录
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10)，igraph(> = 1.0)
进口	AnnotationDbi，DBI，RSQLite
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，MotifDb，图，PWMEnrich，biomaRt，knitr，Biostrings，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.masked，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ddiez/rTRM
BugReports	https://github.com/ddiez/rTRM/issues
全靠我
进口我	rTRMui
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rTRM_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	rTRM_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rTRM_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rTRM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rTRM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rTRM/
软件包下载报告	下载数据