rTRM

DOI:10.18129 / B9.bioc.rTRM

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见rTRM

从PPI网络中鉴定转录调节模块

Bioconductor版本:3.9

rTRM识别蛋白质-蛋白质相互作用网络中的转录调节模块(TRMs)。

作者:Diego Diez

维护者:Diego Diez

引文(从R内,输入引用(“rTRM”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("rTRM")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“rTRM”)

PDF R脚本 rTRM介绍
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneRegulationGraphAndNetwork网络软件转录
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.10),igraph(> = 1.0)
进口 AnnotationDbiDBIRSQLite
链接
建议 RUnitBiocGenericsMotifDbPWMEnrichbiomaRtknitrBiostringsBSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.maskedorg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dbggplot2
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/ddiez/rTRM
BugReports https://github.com/ddiez/rTRM/issues
全靠我
进口我 rTRMui
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 rTRM_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 rTRM_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) rTRM_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rTRM
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rTRM
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rTRM/
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Bioconductor

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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网