projectR

DOI:10.18129 / B9.bioc.projectR

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅projectR

从主成分分析权重函数的投影,CoGAPS, NMF、相关性和集群

Bioconductor版本:3.9

函数的投影数据空间利用主成分分析法(PCA)定义,CoGAPS, NMF、相关性和集群。

作者:Gaurav沙玛,吉纳维芙Stein-O ' brien

维护人员:吉纳维芙Stein-O ' brien < gsteinobrien gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“projectR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“projectR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“projectR”)

PDF R脚本 projectR
PDF 参考手册

细节

biocViews BiologicalQuestion,FunctionalPrediction,GeneRegulation,软件
版本 1.0.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (r - 3.6)(< 6个月)
许可证 GPL (= = 2)
取决于
进口 方法,集群统计数据,limma,CoGAPS,NMF,ROCR
链接
建议 BiocStyle,gridExtra、网格testthat,devtools,knitr,rmarkdown,ComplexHeatmap,冬青,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/genesofeve/projectR/
BugReports https://support.bioconductor.org/t/projectR/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 projectR_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 projectR_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) projectR_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/projectR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ projectR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/projectR/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网