phemd

DOI:10.18129 / B9.bioc.phemd

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅phemd。

表型EMD单细胞样本的比较

Bioconductor版本:3.9

方案比较和生成多个单细胞样本的低维嵌入。

作者:陈威廉S

< wil.yum维护者:威廉·陈。陈在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“phemd”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“phemd”)

HTML	R脚本	PhEMD装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类,ComparativeGenomics,DataRepresentation,DimensionReduction,MultipleComparison,蛋白质组学,测序,SingleCell,软件,转录组,可视化
版本	1.0.1
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(< 6个月)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.6),单片眼镜
进口	SingleCellExperiment,RColorBrewer,igraph,运输,pracma,集群,Rtsne,命运,修拉,RANN,ggplot2,maptree,pheatmap,scatterplot3d,VGAM、方法、grDevices图形、统计、跑龙套,cowplot,S4Vectors,BiocGenerics,SummarizedExperiment,Biobase
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	phemd_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	phemd_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	phemd_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phemd
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ phemd
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/phemd/
包下载报告	下载数据