这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pcxn。
Bioconductor版本:3.9
发现相关通路/基因组一个通路/设置或发现多个通路/基因集之间的相关关系。画一个热图或者创建一个网络查询和提取每个通路/基因集的成员中找到可用的集合(MSigDB H标志,MSigDB C2规范途径,MSigDB C5 BP和Pathprint)。
作者:Sokratis Kariotis,要是Pita-Juarez,温斯顿隐藏,Wenbin魏
维护人员:Sokratis Kariotis < s。在sheffield.ac.uk kariotis >
从内部引用(R,回车引用(“pcxn”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pcxn”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“pcxn”)
R脚本 | pcxn | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | ExperimentData,ExpressionData,地理,Homo_sapiens_Data,MicroarrayData,OneChannelData,PathwayInteractionDatabase,软件 |
版本 | 2.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(2年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可 |
取决于 | R (> = 3.4),pcxnData |
进口 | 方法、grDevices跑龙套,pheatmap |
链接 | |
建议 | igraph,注释,org.Hs.eg.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | pcxnData |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | pcxn_2.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | pcxn_2.6.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | pcxn_2.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcxn |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pcxn |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pcxn/ |
包下载报告 | 下载数据 |