pcaGoPromoter

DOI:10.18129 / B9.bioc.pcaGoPromoter

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见pcaGoPromoter．

pcaGoPromoter用于分析DNA微阵列数据

Bioconductor版本:3.9

该软件包包含简化DNA微阵列分析的功能。它利用主成分分析作为初始的多变量分析，然后对主成分维度进行功能解释，对GO术语进行过度表示分析，并使用素数算法对预测的转录因子结合位点进行过度表示分析。

作者:莫滕·汉森，约根·奥尔森

维护者:Morten Hansen

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("pcaGoPromoter")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“pcaGoPromoter”)

PDF	R脚本	pcaGoPromoter
PDF		参考手册

细节

biocViews	去，GeneExpression，微阵列，软件，可视化
版本	1.28.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(7.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.14.0)，椭圆，Biostrings
进口	AnnotationDbi
链接
建议	Rgraphviz，GO.db，hgu133plus2.db，mouse4302.db，rat2302.db，hugene10sttranscriptcluster.db，mogene10sttranscriptcluster.db，pcaGoPromoter.Hs.hg19，pcaGoPromoter.Mm.mm9，pcaGoPromoter.Rn.rn4，serumStimulation、并行
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	pcaGoPromoter_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	pcaGoPromoter_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	pcaGoPromoter_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcaGoPromoter
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pcaGoPromoter
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pcaGoPromoter/
软件包下载报告	下载数据