openCyto

DOI:10.18129 / B9.bioc.openCyto

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见openCyto．

用于流式细胞仪数据的分层门控管道

Bioconductor版本:3.9

该包的设计是为了方便自动门控方法以顺序方式模拟手动门控策略。

作者:Mike Jiang, John Ramey, Greg Finak, Raphael Gottardo

维护者:Mike Jiang

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("openCyto")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“openCyto”)

超文本标记语言	R脚本	openCyto包简介
超文本标记语言	R脚本	如何使用不同的自动门控功能
超文本标记语言	R脚本	如何写一个csv门控模板
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，FlowCytometry，ImmunoOncology，预处理，软件
版本	1.22.2
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	flowWorkspace(> = 3.31.8)
进口	方法,Biobase，BiocGenerics，gtools，flowCore(> = 1.31.17),flowViz，ncdfFlow(> = 2.11.34),flowWorkspace，flowStats(> = 3.29.1),flowClust(> = 3.11.4),质量，线索，plyr，RBGL，图，data.table，ks，RColorBrewer，晶格，rrcov，R.utils
链接	Rcpp
建议	flowWorkspaceData，knitr，testthat， utils，工具，并行，ggcyto，CytoML
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	CytoML
建议我	flowClust，flowCore，ggcyto
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	openCyto_1.22.2.tar.gz
Windows二进制	openCyto_1.22.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	openCyto_1.22.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/openCyto
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/openCyto
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/openCyto/
软件包下载报告	下载数据