ontoProc

DOI:10.18129 / B9.bioc.ontoProc

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ontoProc

处理本体的解剖学、细胞系、等等

Bioconductor版本:3.9

支持不同的收获生物本体,使特定的使用ontologyIndex包在凹口。我们提供关于细胞,快照关键本体术语的细胞系,化合物,解剖学,帮助公司分析实验,特别是细胞x复合屏幕。另一个目的是加强发展引人注目的新兴本体用例更丰富的接口。

作者:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

从内部引用(R,回车引用(“ontoProc”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ontoProc”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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HTML R脚本 ontoProc:一些ontology-oriented公用工程Bioconductor单细胞的焦点
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文本 新闻

细节

biocViews ,基础设施,软件
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(2年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.5),ontologyIndex
进口 Biobase,S4Vectors、方法、AnnotationDbi,统计,跑龙套,闪亮的,,Rgraphviz,ontologyPlot,dplyr,magrittr
链接
建议 knitr,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,testthat,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我 pogo,tenXplore
建议我 BiocOncoTK,TxRegInfra
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ontoProc_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 ontoProc_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) ontoProc_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ontoProc
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ontoProc
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ontoProc/
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