这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见omicsPrint.
Bioconductor版本:3.9
omicsPrint提供了跨组遗传指纹的功能,例如,验证多种组学数据类型之间的样本关系,即基因组、转录组和表观遗传(DNA甲基化)。
作者:Maarten van Iterson [aut], Davy Cats [cre]
维护者:Davy Cats
引文(从R内,输入引用(“omicsPrint”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("omicsPrint")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“omicsPrint”)
超文本标记语言 | R脚本 | omicsPrint:多个组学研究中数据链接错误的检测 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DNAMethylation,表观遗传学,GeneticVariability,遗传学,ImmunoOncology,质量控制,软件,转录,转录组 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 3.7 (R-3.5)(1.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.5),质量 |
进口 | 方法,matrixStats,图形,统计,SummarizedExperiment,MultiAssayExperiment,RaggedExperiment |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,GEOquery,VariantAnnotation,Rsamtools,BiocParallel,GenomicRanges,FDb.InfiniumMethylation.hg19,snpStats |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | omicsPrint_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | omicsPrint_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | omicsPrint_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicsPrint |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/omicsPrint |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/omicsPrint/ |
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