omicsPrint

DOI:10.18129 / B9.bioc.omicsPrint

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见omicsPrint

交叉组遗传指纹

Bioconductor版本:3.9

omicsPrint提供了跨组遗传指纹的功能,例如,验证多种组学数据类型之间的样本关系,即基因组、转录组和表观遗传(DNA甲基化)。

作者:Maarten van Iterson [aut], Davy Cats [cre]

维护者:Davy Cats

引文(从R内,输入引用(“omicsPrint”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("omicsPrint")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“omicsPrint”)

超文本标记语言 R脚本 omicsPrint:多个组学研究中数据链接错误的检测
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylation表观遗传学GeneticVariability遗传学ImmunoOncology质量控制软件转录转录组
版本 1.4.0
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(1.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.5),质量
进口 方法,matrixStats,图形,统计,SummarizedExperimentMultiAssayExperimentRaggedExperiment
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdowntestthatGEOqueryVariantAnnotationRsamtoolsBiocParallelGenomicRangesFDb.InfiniumMethylation.hg19snpStats
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 omicsPrint_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 omicsPrint_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) omicsPrint_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicsPrint
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/omicsPrint
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/omicsPrint/
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