该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Omicrexposom。
生物导体版本:3.9
OMICREXPOSOME系统地将暴露与OMIC数据之间的关联评估系统化,利用多ataTASET用于协调的数据管理,rexposoms用于exposome数据定义和关联测试的LIMMA。还可以使用多共同分析(Omicade4)和多典型相关分析(PMA)执行数据集成混合示波器和OMIC数据。
作者:Carles Hernandez-Ferrer [AUT,CRE],Juan R.González[aut]
维护者:Carles Hernandez-Ferrer
引用(从r内,输入引用(“ imicrexposome”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ omicrexposome”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ omicrexposome”)
html | R脚本 | 与OMIC数据相结合 |
参考手册 | ||
文本 | 执照 |
生物浏览 | 差异性,,,,差甲基化,,,,表观遗传学,,,,基因表达,,,,结肠管制,,,,免疫学,,,,多重组合,,,,蛋白质组学,,,,回归,,,,软件,,,,统计信息,,,,转录组学,,,,可视化,,,,工作流程 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(2年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | r(> = 3.4),生物酶 |
进口 | 统计,UTILS,GRDEVICES,图形,方法,rexposom,,,,林玛,,,,SVA,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,PMA,,,,Omicade4,,,,栅格,,,,多胎,,,,Smartsva,,,,ISVA, 平行,总结性特征,,,,Stringr |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,snpstats,,,,Brgedata |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | omicrexposome_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | omicrexposome_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | omicrexposome_1.6.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicrexposome |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/omicrexposome |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/omicrexposome/ |
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