oligoClasses
DOI:
10.18129 / B9.bioc.oligoClasses
这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅oligoClasses。
类大规模数组由低聚糖和crlmm支持
Bioconductor版本:3.9
有效性检查,这包包含类定义和初始化方法的类使用的低聚糖和crlmm包。
作者:Benilton卡瓦略和罗伯特Scharpf
维护人员:Benilton卡瓦略< beniltoncarvalho gmail.com >和罗伯特Scharpf < rscharpf jhsph.edu >
从内部引用(R,回车引用(“oligoClasses”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“oligoClasses”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
细节
| biocViews |
基础设施,软件 |
| 版本 |
1.46.0 |
| Bioconductor自 |
BioC 2.1 (r - 2.6)(12年) |
| 许可证 |
GPL (> = 2) |
| 取决于 |
R (> = 2.14) |
| 进口 |
BiocGenerics(> = 0.27.1),Biobase(> = 2.17.8)、方法、图形IRanges(> = 2.5.17),GenomicRanges(> = 1.23.7),SummarizedExperiment,Biostrings(> = 2.23.6),affyio(> = 1.23.2),ff,foreach,BiocManager跑龙套,S4Vectors(> = 0.9.25),RSQLite,DBI |
| 链接 |
|
| 建议 |
hapmapsnp5,hapmapsnp6,pd.genomewidesnp.6,pd.genomewidesnp.5,pd.mapping50k.hind240,pd.mapping50k.xba240,pd.mapping250k.sty,pd.mapping250k.nsp,genomewidesnp6Crlmm(> = 1.0.7),genomewidesnp5Crlmm(> = 1.0.6),RUnit,human370v1cCrlmm,SNPchip,VanillaICE,crlmm |
| SystemRequirements |
|
| 增强了 |
doMC,doMPI,doSNOW,doParallel,doRedis |
| URL |
|
| 取决于我 |
cn.farms,crlmm,maEndToEnd,mBPCR,益生元,pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1,pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter,pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter,pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter,pd.ag,pd.aragene.1.0.st,pd.aragene.1.1.st,pd.atdschip.tiling,pd.ath1.121501,pd.barley1,pd.bovgene.1.0.st,pd.bovgene.1.1.st,pd.bovine,pd.bsubtilis,pd.cangene.1.0.st,pd.cangene.1.1.st,pd.canine,pd.canine.2,pd.celegans,pd.charm.hg18.example,pd.chicken,pd.chigene.1.0.st,pd.chigene.1.1.st,pd.chogene.2.0.st,pd.chogene.2.1.st,pd.citrus,pd.clariom.d.human,pd.clariom.s.human,pd.clariom.s.human.ht,pd.clariom.s.mouse,pd.clariom.s.mouse.ht,pd.clariom.s.rat,pd.clariom.s.rat.ht,pd.cotton,pd.cyngene.1.0.st,pd.cyngene.1.1.st,pd.cyrgene.1.0.st,pd.cyrgene.1.1.st,pd.cytogenetics.array,pd.drogene.1.0.st,pd.drogene.1.1.st,pd.drosgenome1,pd.drosophila.2,pd.e.coli.2,pd.ecoli,pd.ecoli.asv2,pd.elegene.1.0.st,pd.elegene.1.1.st,pd.equgene.1.0.st,pd.equgene.1.1.st,pd.feinberg.hg18.me.hx1,pd.feinberg.mm8.me.hx1,pd.felgene.1.0.st,pd.felgene.1.1.st,pd.fingene.1.0.st,pd.fingene.1.1.st,pd.genomewidesnp.5,pd.genomewidesnp.6,pd.guigene.1.0.st,pd.guigene.1.1.st,pd.hc.g110,pd.hg.focus,pd.hg.u133.plus.2,pd.hg.u133a,pd.hg.u133a.2,pd.hg.u133a.tag,pd.hg.u133b,pd.hg.u219,pd.hg.u95a,pd.hg.u95av2,pd.hg.u95b,pd.hg.u95c,pd.hg.u95d,pd.hg.u95e,pd.hg18.60mer.expr,pd.ht.hg.u133.plus.pm,pd.ht.hg.u133a,pd.ht.mg.430a,pd.hta.2.0,pd.hu6800,pd.huex.1.0.st.v2,pd.hugene.1.0.st.v1,pd.hugene.1.1.st.v1,pd.hugene.2.0.st,pd.hugene.2.1.st,pd.maize,pd.mapping250k.nsp,pd.mapping250k.sty,pd.mapping50k.hind240,pd.mapping50k.xba240,pd.margene.1.0.st,pd.margene.1.1.st,pd.medgene.1.0.st,pd.medgene.1.1.st,pd.medicago,pd.mg.u74a,pd.mg.u74av2,pd.mg.u74b,pd.mg.u74bv2,pd.mg.u74c,pd.mg.u74cv2,pd.mirna.1.0,pd.mirna.2.0,pd.mirna.3.0,pd.mirna.3.1,pd.mirna.4.0,pd.moe430a,pd.moe430b,pd.moex.1.0.st.v1,pd.mogene.1.0.st.v1,pd.mogene.1.1.st.v1,pd.mogene.2.0.st,pd.mogene.2.1.st,pd.mouse430.2,pd.mouse430a.2,pd.mta.1.0,pd.mu11ksuba,pd.mu11ksubb,pd.nugo.hs1a520180,pd.nugo.mm1a520177,pd.ovigene.1.0.st,pd.ovigene.1.1.st,pd.pae.g1a,pd.plasmodium.anopheles,pd.poplar,pd.porcine,pd.porgene.1.0.st,pd.porgene.1.1.st,pd.rabgene.1.0.st,pd.rabgene.1.1.st,pd.rae230a,pd.rae230b,pd.raex.1.0.st.v1,pd.ragene.1.0.st.v1,pd.ragene.1.1.st.v1,pd.ragene.2.0.st,pd.ragene.2.1.st,pd.rat230.2,pd.rcngene.1.0.st,pd.rcngene.1.1.st,pd.rg.u34a,pd.rg.u34b,pd.rg.u34c,pd.rhegene.1.0.st,pd.rhegene.1.1.st,pd.rhesus,pd.rice,pd.rjpgene.1.0.st,pd.rjpgene.1.1.st,pd.rn.u34,pd.rta.1.0,pd.rusgene.1.0.st,pd.rusgene.1.1.st,pd.s.aureus,pd.soybean,pd.soygene.1.0.st,pd.soygene.1.1.st,pd.sugar.cane,pd.tomato,pd.u133.x3p,pd.vitis.vinifera,pd.wheat,pd.x.laevis.2,pd.x.tropicalis,pd.xenopus.laevis,pd.yeast.2,pd.yg.s98,pd.zebgene.1.0.st,pd.zebgene.1.1.st,pd.zebrafish,彪马,waveTiling |
| 进口我 |
affycoretools,ArrayTV,魅力,frma,斜体,mimager,MinimumDistance,pdInfoBuilder,彪马,SNPchip,VanillaICE |
| 建议我 |
BiocGenerics,hapmapsnp6 |
| 我的链接 |
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| 构建报告 |
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