normr

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅normr。

调用ChIP-seq数据规范化和区别

Bioconductor版本:3.9

健壮的规范化和区别ChIP-seq调用程序和数据。读统计建模共同作为一个二项与指定数量的组件混合模型。合身的背景估计占浓缩在某些地区的影响,因此,代表了一个适当的零假设。这个健壮的背景是用来识别显著富集或贫化区。

作者:约翰内斯·赫尔穆特(aut (cre) Ho-Ryun涌(aut)

维护人员:约翰内斯·赫尔穆特在molgen.mpg.de > <赫尔穆特

从内部引用(R,回车引用(“normr”)):

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“normr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“normr”)

biocViews	对齐,贝叶斯,ChIPSeq,分类,DataImport,DifferentialPeakCalling,FunctionalGenomics,遗传学,MultipleComparison,归一化,PeakDetection,预处理,RIPSeq,软件
版本	1.10.0