NetBenchmark

doi:10.18129/b9.bioc.netbenchmark

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅NetBenchmark

几种基因网络推断方法的基准测试

生物导体版本:3.9

该软件包实现了来自基因表达数据的几种基因网络推断算法的基准测试。

作者:Pau Bellot,Catharina Olsen,Patrick Meyer

维护者:pau bellot

引用(从r内,输入引用(“ netbench”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ netBenchmark”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ NetBench Markc Marks”)

html R脚本 NetBenchmark
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 基因表达,,,,GraphandNetwork,,,,微阵列,,,,网络,,,,网络引导,,,,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(4。5年)
执照 CC BY-NC-SA 4.0
要看 Grndata(> = 0.99.3)
进口 RCPP(> = 0.11.0),模丝,,,,Genie3,,,,C3net,,,,PCIT,,,,Genenet, 工具,pracma,,,,矩阵,,,,公司,,,,fdrtool
链接 RCPP
建议 运行,,,,生物基因,,,,尼特,,,,图形
系统要求
增强
URL https://imatge.upc.edu/netbenchmark/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 NetBenchmark_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 NetBenchmark_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) NetBenchmark_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/netbenchmark
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/netbenchmark
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/netbenchmark/
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