mzID

DOI:10.18129 / B9.bioc.mzID

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见mzID．

R的mzIdentML解析器

Bioconductor版本:3.9

使用XML包实现的mzIdentML文件解析器。解析器试图通用，能够处理所有类型的mzIdentML文件，缺点是与特定于供应商的解析器相比输出更“漂亮”。请联系维护人员与任何问题，并提供一个mzIdentML文件，以便问题可以快速修复。

作者:Laurent Gatto，托马斯·佩德森[au]， Vladislav Petyuk [ctb]

维护者:Laurent Gatto < Laurent。uclouvain的Gatto。be>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("mzID")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“mzID”)

PDF	R脚本	使用mzID
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，ImmunoOncology，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件
版本	1.22.0
在Bioconductor公司	BioC 2.13 (R-3.0)(6年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	方法
进口	XML，plyr平行,doParallel，foreach，迭代器，ProtGenerics
链接
建议	knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	蛋白质组学
进口我	MSGFgui，MSGFplus，MSnbase，MSnID，Pbase
建议我	mzR，RforProteomics
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	mzID_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	mzID_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	mzID_1.22.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/mzID
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mzID
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mzID/
软件包下载报告	下载数据