msgbsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.msgbsR

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅msgbsR。

msgbsR:甲基化敏感的基因测序(MS-GBS) R功能

Bioconductor版本:3.9

管道的分析MS-GBS实验。

作者:本杰明·梅恩

维修工:本杰明·梅恩<本杰明。梅恩在adelaide.edu.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“msgbsR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“msgbsR”)

PDF	R脚本	msgbsR_Example
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,DifferentialMethylation,表观遗传学,ImmunoOncology,MethylSeq,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.4),GenomicRanges、方法
进口	BSgenome,easyRNASeq,刨边机,GenomicAlignments,GenomicFeatures,GenomeInfoDb,ggbio,ggplot2,IRanges平行,plyr,Rsamtools,R.utils统计数据,SummarizedExperiment,S4Vectors,跑龙套
链接
建议	roxygen2,BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn6
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	msgbsR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	msgbsR_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	msgbsR_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msgbsR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ msgbsR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/msgbsR/
包下载报告	下载数据