mirsponger

doi:10.18129/b9.bioc.mirsponger

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅mirsponger

miRNA海绵相互作用网络和模块的识别和分析

生物导体版本:3.9

该软件包提供了一些研究miRNA海绵(也称为Cerna或miRNA诱饵)的功能,包括流行的方法来识别miRNA海绵相互作用,以及从不同方法中整合miRNA海绵相互作用的整合方法,以及验证miRNA海绵相互作用的功能,并推断miRNA海绵模块,对模块进行富集分析,并进行模块的存活分析。

作者:Junpeng Zhang

维护者:yahoo.com> junpeng zhang

引用(从r内,输入引用(“ mirsponger”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mirsponger”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ mirsponger”)

html R脚本 mirsponger:miRNA海绵相互作用网络和模块的识别和分析
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 生物医学信息学,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,NetworkEnrichment,,,,软件,,,,生存
版本 1.10.1
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(<6个月)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.5.0)
进口 公司, 平行,Igraph,,,,MCL,,,,clusterProfiler,,,,Reactomepa,,,,剂量,,,,生存,grdevices,图形,统计信息,varhandle,,,,linkComm,utils,RCPP,,,,org.hs.eg.db
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/zhangjunpeng411/mirsponger/issues
取决于我
进口我 mirsm
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 mirsponger_1.10.1.tar.gz
Windows二进制 mirsponger_1.10.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) mirsponger_1.10.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mirsponger
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/mirsponger
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mirsponger/
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