Mirsponge.

DOI：10.18129 / b9.bioc.mirsponge.

这个包是弃用。它可能会从生物导体中移除。请参考套餐终身指南想要查询更多的信息。

此包是Biocumonductor的3.9版。该包装已从Biocumon中删除。对于最后一个稳定的最新版本版本，请参阅Mirsponge.（更名为Mirsponger）。

miRNA海绵交互网络和模块的识别与分析

生物导体版本：3.9

mirsponge包的名称已更改为“mirsponger”。将在Mirsponger包中看到未来的更新（http://biocondudard.org/packages/mirsponger/）。该套餐提供了研究miRNA海绵（也称为Cerna或MiRNA诱饵）的几种功能，包括鉴定miRNA海绵相互作用的流行方法，以及将MiRNA海绵与不同方法的相互作用集成的综合方法，以及验证miRNA海绵交互的功能和推断miRNA海绵模块，进行模块的富集分析，并进行模块的存活分析。

作者：君鹏张

维护者：Junpeng Zhang

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“mirsponge”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“MIRSPONGE”）

HTML.	r script.	mirsponge：miRNA海绵交互网络和模块的识别和分析
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	BioMeDicalInformatics那基因表达那微阵列那NetworkenRichment.那软件那生存
版本	1.10.0
在生物导体中以来	BIOC 3.6（R-3.4）（2年）
执照	GPL-3
依靠	r（> = 3.5.0）
进口	CORPCOR.， 平行，iGraph.那蒙那ClusterProfiler.那反弹那剂量那生存，grdevices，图形，统计数据，varhandle.那Linkcomm.，实用，rcpp.那org.hs.eg.db.
链接到
建议	生物焦那kn那RAMAMAMDOW.那testthat.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	mirsponge_1.10.0.tar.gz.
Windows二进制文件	mirsponge_1.10.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	mirsponge_1.10.0.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/mirsponge.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ mirsponge
包短网址	https://biocumon.org/packages/mirsponge/
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