miRNAtap

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRNAtap

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅miRNAtap。

miRNAtap:微目标-聚合的预测

Bioconductor版本:3.9

包方便的实现工作流需要microrna的预测,它允许集成网上排名来自多个源的microrna的目标预测,总以各种方法可以改善预测的质量高于任何单一来源。目前可用于预测智人,亩肌肉和鼠形(最后一个通过同源性翻译)。

作者:Maciej Pajak, t .伊恩·辛普森

维修工:t伊恩·辛普森<伊恩。辛普森在ed.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“miRNAtap”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“miRNAtap”)

PDF	R脚本	miRNAtap
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类,微阵列,测序,软件,microrna的
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.3.0),AnnotationDbi
进口	DBI,RSQLite,stringr,sqldf,plyr、方法
链接
建议	topGO,org.Hs.eg.db,miRNAtap.db,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	miRNAtap.db
进口我	miRNAtap.db,SpidermiR
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	miRNAtap_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	miRNAtap_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	miRNAtap_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRNAtap
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRNAtap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/miRNAtap/
包下载报告	下载数据