methyvim
doi：10.18129/b9.bioc.methyvim
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅methyvim。
靶向，健壮和无模型差甲基化分析
生物导体版本：3.9
该软件包为基于可变重要性度量（VIM）的差异甲基化分析提供了设施，这是因果推断中出现的一类统计目标参数。所提供的估计和推理程序是非参数的，依靠集成机器学习来灵活地评估协变量之间的功能关系和感兴趣的结果。这些工具可以应用于CPG位点级别的差异甲基化，即使在校正了多个假设测试后，也可以获得有效的统计推断。
作者：Nima Hejazi [AUT，CRE，CPH]，Mark van der Laan [AUT，THS]，Alan Hubbard [CTB，THS]，Rachael Phillips [CTB]
维护者：berkeley.edu>的Nima Hejazi
引用（从r内，输入引用（“ methyvim”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ methyvim”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Methyvim”）
| html | R脚本 | 有针对性的数据自适应估计和差分甲基化分析的推断 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 聚类，，，，DNAMETHYLATY，，，，差甲基化，，，，甲基，，，，甲基化array，，，，软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（2年） |
| 执照 | 文件许可证 |
| 要看 | R（> = 3.4.0） |
| 进口 | 统计，簇， 方法，GGPLOT2，，，，GGSCI，，，，栅格，，，，过热，，，，dplyr，，，，gtools，，，，TMLE，，，，未来，，，，dofuture，，，，S4VECTORS，，，，生物基因，，，，生物比较，，，，总结性特征，，，，GenomeInfodB，，，，Bumphunter，，，，iranges，，，，林玛，，，，Minfi |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，Superlearner，，，，地球，，，，nnet，，，，游戏，，，，手臂，，，，雪， 平行，batchjobs，，，，Minfidata，，，，Methyvimdata |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/nhejazi/methyvim |
| BugReports | https://github.com/nhejazi/methyvim/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | methyvim_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | methyvim_1.6.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | methyvim_1.6.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methyvim |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/methyvim |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/methyvim/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
