这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见methimpute.
Bioconductor版本:3.9
该包实现了调用基因组中所有胞嘧啶甲基化的功能。
作者:Aaron Taudt
维护者:Aaron Taudt < Aaron。Taudt在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“methimpute”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("methimpute")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“methimpute”)
R脚本 | 甲基化状态调用METHimpute | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 报道,DNAMethylation,表观遗传学,HiddenMarkovModel,ImmunoOncology,测序,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.4.0),GenomicRanges,ggplot2 |
进口 | Rcpp(>= 0.12.4.5),方法,utils, grDevices, stats,GenomeInfoDb,IRanges,Biostrings,reshape2,minpack.lm,data.table |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | methimpute_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | methimpute_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | methimpute_1.6.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methimpute |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/methimpute |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/methimpute/ |
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