methInheritSim

DOI:10.18129 / B9.bioc.methInheritSim

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅methInheritSim。

模拟全基因组遗传亚硫酸氢盐测序数据

Bioconductor版本:3.9

模拟multigeneration甲基化情况和控制实验与继承关系数据集使用一个真正的控制。

作者:阿斯特丽德帕斯卡尔•Belleau Deschenes Arnaud所有权

维护人员:帕斯卡Belleau < pascal_belleau hotmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“methInheritSim”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“methInheritSim”)

HTML	R脚本	模拟全基因组遗传亚硫酸氢盐测序数据
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细节

biocViews	BiologicalQuestion,DNAMethylation,DifferentialMethylation,表观遗传学,ImmunoOncology,MethylSeq,测序,软件,StatisticalMethod,WholeGenome
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4)
进口	methylKit,GenomicRanges,GenomeInfoDb平行,BiocGenerics,S4Vectors、方法、统计数据IRanges,二甲基砜
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,RUnit,methylInheritance
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/belleau/methInheritSim
BugReports	https://github.com/belleau/methInheritSim/issues
取决于我
进口我
建议我	methylInheritance
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	methInheritSim_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	methInheritSim_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	methInheritSim_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methInheritSim
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ methInheritSim
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/methInheritSim/
包下载报告	下载数据