微波激射器

DOI:10.18129 / B9.bioc.maser

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅微波激射器。

可变剪接事件映射到蛋白质

Bioconductor版本:3.9

这个包为下游提供了功能分析、注释和visualizaton rMATS产生的可变剪接事件。

作者:•迪奥戈F.T. Veiga (aut (cre)

维护人员:•迪奥戈F.T. Veiga < diogof。在gmail.com veiga >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“微波激射器”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“微波激射器”)

HTML	R脚本	介绍
HTML	R脚本	蛋白质特性映射到剪接事件
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	AlternativeSplicing,软件,转录组,可视化
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(1年)
许可证	麻省理工学院+文件许可
取决于	R (> = 3.5.0),ggplot2,GenomicRanges
进口	dplyr,rtracklayer,reshape2,Gviz,DT,GenomeInfoDb,统计,跑龙套,IRanges、方法、BiocGenerics平行,data.table
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,AnnotationHub
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/DiogoVeiga/maser
BugReports	https://github.com/DiogoVeiga/maser/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	maser_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	maser_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	maser_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/maser
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/微波激射器
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/maser/
包下载报告	下载数据