该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅loci2path。
生物导体版本:3.9
Loci2Path对eqTL进行了统计富集分析,对基因组感兴趣的基因组区域进行了统计。使用来自MSIGDB的基因型组织表达(GTEX)项目和途径收集提供的EQTL集合。
作者:Tianlei Xu
维护者:tianlei xu
引用(从r内,输入引用(“ loci2path”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ loci2path”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ loci2path”)
html | R脚本 | loci2path |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 生物卡尔塔,,,,覆盖范围,,,,功能基因组学,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,遗传学,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(1。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.4) |
进口 | pheatmap,,,,WordCloud,,,,rcolorbrewer,,,,Data.Table,方法,grdevices,统计,图形,基因组机,,,,生物比较,,,,S4VECTORS |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/stanleyxu/loci2path |
BugReports | https://github.com/stanleyxu/loci2path/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | loci2path_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | loci2path_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | loci2path_1.4.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/loci2path |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/loci2path |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/loci2path/ |
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