核粒子
doi：10.18129/b9.bioc.karyoploter
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅核粒子。
绘制显示任意数据的可自定义线性基因组
生物导体版本：3.9
Karyoploter创建了任意基因组的核型图，并提供了完整的功能来绘制其上的任意数据。它模仿许多R基本图形功能将它们与坐标更改函数结合起来，将染色体和数据坐标自动映射到图坐标中。除了提供的数据绘图函数外，添加新的功能也很容易。
作者：bernat gel
维护者：igtp.cat上的bernat凝胶
引用（从r内，输入引用（“ Karyoploter”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ karyoploter”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“核粒子”）
| html | R脚本 | Karyoploter Vignette |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，库务，，，，覆盖范围，，，，dnaseq，，，，DataImport，，，，甲基，，，，Onechannel，，，，测序，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.10.5 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.5（R-3.4）（2。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 依靠 | r（> = 3.4），区域人，，，，基因组机， 方法 |
| 进口 | 区域人，，，，基因组机，，，，iranges，，，，rsamtools，统计，图形，备忘录，，，，rtracklayer，，，，GenomeInfodB，，，，S4VECTORS，，，，Biovizbase，，，，消化，，，，Bezier，，，，GenomicFeatures，，，，bamsignals，，，，AnnotationDbi，grdevices |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，测试，，，，马格里特，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，pasillabamsubset |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/bernatgel/karyoploter |
| BugReports | https://github.com/bernatgel/karyoploter/issues |
| 取决于我 | 库务 |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | karyoploter_1.10.5.tar.gz |
| Windows二进制 | karyoploter_1.10.5.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | karyoploter_1.10.5.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/karyoploter |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/karyoploter |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/karyoploter/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
