ipdDb

DOI:10.18129 / B9.bioc.ipdDb

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见ipdDb．

智人IPD IMGT/HLA和IPD KIR数据库

Bioconductor版本:3.9

所有等位基因均来自IPD IMGT/HLA和IPD KIR智人数据库。参考文献:Robinson J, Maccari G, Marsh SGE, Walter L, Blokhuis J, Bimber B, Parham P, De Groot NG, Bontrop RE, Guethlein LA, and Hammond JA KIR Nomenclature in non-human species Immunogenetics(2018)，正在准备中。

作者:Steffen Klasberg

维护者:Steffen Klasberg < Klasberg at dkms-lab.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ipdDb")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ipdDb”)

超文本标记语言	R脚本	ipdDb
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，GenomicVariation，SequenceMatching，软件，VariantAnnotation
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.5.0)，方法，AnnotationDbi(> = 1.43.1),AnnotationHub
进口	Biostrings，GenomicRanges，RSQLite，DBI，IRanges统计数据,为了
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/DKMS-LSL/ipdDb
BugReports	https://github.com/DKMS-LSL/ipdDb/issues/new
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ipdDb_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	ipdDb_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ipdDb_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ipdDb
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ipdDb
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ipdDb/
软件包下载报告	下载数据