htseqtools
doi：10.18129/b9.bioc.htseqtools
此软件包适用于生物导体的3.9版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本，请参阅htseqtools。
高通量测序数据的质量控制，可视化和处理
生物导体版本：3.9
我们为高通量测序（CHIP-SEQ，RNASEQ等）提供有效，易于使用的工具。其中包括MDS图（对PCA的类似物），检测效率低下的免疫沉淀或过度放大的工件，识别和测试具有大量读取的基因组区域的工具以及覆盖范围的可视化。
作者：Evarist Planet，Camille Stephan-Totto，Oscar Reina，Oscar Flores，David Rossell
维护者：Oscar Reina
引用（从r内，输入引用（“ htseqtools”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ htseqtools”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ htseqtools”）
| R脚本 | htseqtools库的手册 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | QualityControl，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.31.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（8年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 2.12.2），方法，生物基因（> = 0.1.0），生物酶，，，，S4VECTORS，，，，iranges， 方法，大量的，，，，BSGENOME，，，，GenomeInfodB（> = 1.1.3），基因组机（> = 1.17.11） |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | 平行，多核 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | htseqtools_1.31.0.tar.gz |
| Windows二进制 | htseqtools_1.31.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | htseqtools_1.31.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/htseqtools |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/htseqtools |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/htseqtools/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
