hierGWAS

DOI:10.18129 / B9.bioc.hierGWAS

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅hierGWAS。

红富士苹果在预测GWA研究统计学意义

Bioconductor版本:3.9

测试单个snp,以及任意大批snp在GWA研究中,使用一个联合模型的snp。弗兰克-威廉姆斯控制的方法,并提供了一个自动的,数据驱动的细化的SNP集群,以较小的团体或单一标记。

作者:劳拉Buzdugan

维护人员:劳拉Buzdugan < Buzdugan在stat.math.ethz.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“hierGWAS”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“hierGWAS”)

PDF	R脚本	用户手册R-Package hierGWAS
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,LinkageDisequilibrium,单核苷酸多态性,软件
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.2.0)
进口	fastcluster,glmnet,fmsb
链接
建议	BiocGenerics,RUnit,质量
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	hierGWAS_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	hierGWAS_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	hierGWAS_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hierGWAS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ hierGWAS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hierGWAS/
包下载报告	下载数据