Gwascat

doi:10.18129/b9.bioc.gwascat

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Gwascat

在EMBL-EBI GWAS目录中代表和建模数据

生物导体版本:3.9

在EMBL-EBI GWAS目录中代表和建模数据。

作者:vj Carey

维护者:vj Carey

引用(从r内,输入引用(“ Gwascat”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gwascat”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Gwascat”)

PDF R脚本 Gwascat-探索NHGRI GWAS目录
html R脚本 GWASCAT- GRANGE for GWAS HITS中的EBI目录
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 遗传学,,,,软件
版本 2.16.1
在生物导体中 Bioc 2.10(R-2.15)(7。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.5.0),同性恋
进口 方法,生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.29.6),GenomicFeatures,,,,生物弦,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,AnnotationDbi
链接
建议 do.db,,,,DT,utils,尼特,,,,rbgl,,,,运行,,,,snpstats,,,,GVIZ,,,,变体,,,,AnnotationHub,,,,gqtlstats,,,,图形,,,,GGBIO,,,,GGPLOT2,,,,延迟
系统要求
增强 snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37
URL
取决于我 举起,,,,vtpnet
进口我
建议我 GenomicsCores,,,,GQTLBASE,,,,gqtlstats,,,,grasp2db,,,,hmdbquery,,,,parglms,,,,tfutils
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gwascat_2.16.1.tar.gz
Windows二进制 gwascat_2.16.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) gwascat_2.16.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/gwascat
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/gwascat/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网