gsean

DOI:10.18129 / B9.bioc.gsean

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅gsean。

基因集富集分析网络

Bioconductor版本:3.9

生物分子在生物很少单独工作。他们通常彼此合作的方式进行交互。生物过程太复杂,理解不考虑这样的交互。因此,基于网络的程序可以被视为强大的方法来研究复杂的过程。然而,许多分析方法设计了单个基因。据说基因技术基于生物网络如co-expression比那些使用更精确的方式来表示信息列表的基因。这个包的目的是将基因表达和生物网络。生物网络是由基因表达数据和用于基因集富集分析。

作者:Dongmin荣格

维护人员:Dongmin荣格< dmdmjung gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“gsean”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“gsean”)

HTML	R脚本	gsean
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,网络,NetworkEnrichment,通路,软件,StatisticalMethod
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5),fgsea,PPInfer
进口
链接
建议	SummarizedExperiment,knitr,情节,排名,WGCNA
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	gsean_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	gsean_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	gsean_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gsean
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gsean
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gsean/
包下载报告	下载数据