该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Goseq。
生物导体版本:3.9
检测RNA-seq数据中代表的基因本体论和/或其他用户定义的类别
作者:Matthew Young
维护者:Matthew Young
引用(从r内,输入引用(“ Goseq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ goseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Goseq”)
R脚本 | Goseq用户指南 | |
参考手册 |
生物浏览 | 去,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 1.36.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.6(R-2.11)(9。5年) |
执照 | LGPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.11.0),偏见,,,,Genelendatabase(> = 1.9.2) |
进口 | MGCV,图形,统计,utils,AnnotationDbi,,,,go.db,,,,生物基因 |
链接 | |
建议 | EDGER,,,,org.hs.eg.db,,,,rtracklayer |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | RGSEPD |
进口我 | 冠军,,,,理想的,,,,途径图,,,,Smite |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | goseq_1.36.0.tar.gz |
Windows二进制 | goseq_1.36.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | goseq_1.36.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/goseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/goseq |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/goseq/ |
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