genphen

DOI:10.18129 / B9.bioc.genphen

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅genphen。

量化的工具关联基因型和表型之间的全基因组关联研究(GWAS)与贝叶斯推理和统计学习

Bioconductor版本:3.9

基因关联研究必不可少的工具来进行基因型和表型之间的关系研究。genphen我们可以共同研究多个不同类型的表型,通过量化不同基因型和表型之间的联系使用混合方法使用统计学习技术,如随机森林和支持向量机,使用分层模型和贝叶斯推理。

作者:单Kitanovski (aut (cre)

维护人员:单Kitanovski <极点。在uni-due.de kitanovski >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“genphen”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“genphen”)

PDF	R脚本	genphen概述
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,分类,FeatureExtraction,遗传学,GenomeWideAssociation,回归,SequenceMatching,测序,软件,SupportVectorMachine
版本	1.12.1
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(3.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.5.0),Rcpp(> = 0.12.17)方法、统计图形
进口	rstan(> = 2.17.3),管理员平行,foreach,doParallel,e1071,Biostrings,rPref
链接
建议	testthat,ggplot2,gridExtra,猿,ggrepel,knitr,重塑,xtable
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	genphen_1.12.1.tar.gz
Windows二进制	genphen_1.12.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	genphen_1.12.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genphen
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ genphen
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genphen/
包下载报告	下载数据