GeneFilter

doi:10.18129/b9.bioc.genefilter

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅GeneFilter

GeneFilter:高通量实验过滤基因的方法

生物导体版本:3.9

过滤基因的一些基本功能。

作者:R。Gentleman,V。Carey,W。Huber,F。Hahne

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“基因词”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ GeneFilter”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ GeneFilter”)

PDF R脚本 其他图:独立过滤增加了检测差异表达基因的功率,Bourgon等人,PNAS(2010)
PDF R脚本 独立过滤的诊断
PDF R脚本 如何找到表达谱类似于指定基因的基因
PDF R脚本 使用GeneFilter函数从微阵列数据集过滤基因
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 微阵列,,,,软件
版本 1.66.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 14。5年)
执照 艺术2.0
要看
进口 S4VECTORS(> = 0.9.42),AnnotationDbi,,,,注释,,,,生物酶,图形,方法,统计,生存
链接
建议 班级,,,,HGU95AV2.DB,,,,tkwidgets,,,,全部,,,,,,,,deseq,,,,帕西拉,,,,rcolorbrewer,,,,生物使用,,,,尼特
系统要求
增强
URL
取决于我 A4base,,,,CellHTS2,,,,魅力,,,,cntools,,,,flowsorted.blood.epic,,,,Genemeta,,,,Hiiragi2013,,,,Maendtoend,,,,rnaseqgene,,,,简单,,,,Sispa,,,,SVA
进口我 Affyqcreport,,,,Annmap,,,,ArrayQualityMetrics,,,,类别,,,,CBAF,,,,countsimqc,,,,covrna,,,,deseq,,,,deseq2,,,,dexseq,,,,Eisa,,,,enmix,,,,GCMAP,,,,GGBASE,,,,GISPA,,,,GSRI,,,,ihwpaper,,,,接口,,,,甲基分析,,,,甲基菌,,,,Minfi,,,,mlinterfaces,,,,莫格萨,,,,nbamseq,,,,PCAEXPLORER,,,,佩卡,,,,,,,,林戈,,,,rnainteractmapk,,,,简单,,,,tcgabiolinks,,,,蒂格拉里,,,,XDE,,,,Zinbwave
建议我 AffyExpress,,,,注释,,,,Arraytools,,,,生物探测,,,,Bionet,,,,BloodCancermultiomics2017,,,,类别Compare,,,,分类,,,,,,,,codelink,,,,可乐,,,,compcoder,,,,策划的布拉德达塔,,,,策展,,,,策展人,,,,延迟,,,,富集图,,,,事实设计,,,,FFPE,,,,ffpeexampledata,,,,Gagedata,,,,Genogam,,,,Genomicfiles,,,,gostats,,,,GSAR,,,,gsealm,,,,GSVA,,,,逻辑,,,,Lumi,,,,maqcsubset,,,,mcrestimate,,,,NPGSEA,,,,奥利戈,,,,门索,,,,PVAC,,,,qpgraph,,,,rforpoteomics,,,,风湿性调节wollbold,,,,rtracklayer,,,,siggenes,,,,single.mtec.transcriptomes,,,,SSPA,,,,topgo
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 genefilter_1.66.0.tar.gz
Windows二进制 genefilter_1.66.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) genefilter_1.66.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefilter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/GenFilter
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/
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