geNetClassifier

DOI:10.18129 / B9.bioc.geNetClassifier

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅geNetClassifier。

疾病分类和构建基因网络使用相关基因表达谱

Bioconductor版本:3.9

综合方案自动训练和验证一个多层次SVM分类器基于基因表达数据。提供透明的选择的基因标记,coexpression网络,查询分类器的接口。

作者:Sara Aibar,西莉亚Fontanillo和哈维尔·De Las里瓦斯。生物信息学与功能基因组学。癌症研究中心(CiC-IBMCC CSIC / USAL)。萨拉曼卡。西班牙。

维护人员:莎拉Aibar < saibar在usal.es >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“geNetClassifier”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“geNetClassifier”)

PDF	R脚本	geNetClassifier-vignette
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类,DifferentialExpression,微阵列,软件
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(6.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10.1),Biobase(> = 2.5.5),EBarrays,minet、方法
进口	e1071、图形
链接
建议	leukemiasEset,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了	RColorBrewer,igraph,infotheo
URL	http://www.cicancer.org
取决于我
进口我	bioCancer,癌症
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	geNetClassifier_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	geNetClassifier_1.24.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	geNetClassifier_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geNetClassifier
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ geNetClassifier
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/geNetClassifier/
包下载报告	下载数据