Funtoonorm

doi:10.18129/b9.bioc.funtoonorm

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Funtoonorm

Infinium Human -Methylation 450 Beadchip套件的标准化程序

生物导体版本:3.9

提供了使Illumina Infinium Human甲基化450 Beadchip(Illumina 450k)归一化的功能,校正组织和/或细胞类型。

作者:Celia Greenwood ,Stepan Grinek ,Maxime Turgeon ,Kathleen.ca>

维护者:kathleen klein

引用(从r内,输入引用(“ Funtoonorm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ funtoonorm”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Funtoonorm”)

PDF R脚本 将Inlumina Infinium Human甲基化450K用于多种细胞类型
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,正常化,,,,预处理,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.4)
进口 ,,,,矩阵,,,,Minfi, 方法,Illuminahumanmethylation450Kmanifest,,,,Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19,,,,GenomeInfodB,grdevices,图形,统计
链接
建议 Prettydoc,,,,Minfidata,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Funtoonorm_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 Funtoonorm_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Funtoonorm_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/funtoonorm
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/Funtoonorm
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/funtoonorm/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网