该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Funtoonorm。
生物导体版本:3.9
提供了使Illumina Infinium Human甲基化450 Beadchip(Illumina 450k)归一化的功能,校正组织和/或细胞类型。
作者:Celia Greenwood
维护者:kathleen klein
引用(从r内,输入引用(“ Funtoonorm”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ funtoonorm”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Funtoonorm”)
R脚本 | 将Inlumina Infinium Human甲基化450K用于多种细胞类型 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DNAMETHYLATY,,,,正常化,,,,预处理,,,,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 3.4) |
进口 | 请,,,,矩阵,,,,Minfi, 方法,Illuminahumanmethylation450Kmanifest,,,,Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19,,,,GenomeInfodB,grdevices,图形,统计 |
链接 | |
建议 | Prettydoc,,,,Minfidata,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Funtoonorm_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | Funtoonorm_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Funtoonorm_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/funtoonorm |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/Funtoonorm |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/funtoonorm/ |
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