fmcsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.fmcsR

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅fmcsR。

不宽容的最大公共子结构检索

Bioconductor版本:3.9

fmcsR包引入了一种有效的最大公共子结构(MCS)算法结合小说匹配策略,允许原子和/或债券不匹配的子结构之间共享两个小分子。结果灵活mcs(设施)通常比严格的mcs,导致更多的共同特征的识别源结构,以及更高的灵敏度找到与弱结构相似的化合物。fmcsR包提供了一些实用程序使用设施管理成对复合算法比较,结构相似性搜索和集群。

作者:王阎,泰勒后方,凯文•霍兰托马斯Girke

维护人员:托马斯Girke <托马斯。在ucr.edu girke >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“fmcsR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	fmcsR
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文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,CellBasedAssays,Cheminformatics,聚类,DataImport,基础设施,代谢组学,MicrotitrePlateAssay,遗传药理学,药物基因组学,蛋白质组学,软件,可视化
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(7年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10.0),ChemmineR、方法
进口	RUnit、方法、ChemmineR,BiocGenerics、并行
链接
建议	BiocStyle,knitr,knitcitations,knitrBootstrap
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/girke-lab/fmcsR
取决于我
进口我	Rcpi
建议我	ChemmineR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	fmcsR_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	fmcsR_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	fmcsR_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fmcsR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ fmcsR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/fmcsR/
包下载报告	下载数据