FlowCatchr

doi：10.18129/b9.bioc.flowcatchr

该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅FlowCatchr。

分析体内显微镜成像数据的工具，重点是跟踪流动的血细胞

生物导体版本：3.9

FlowCatchR是一组用于分析体内显微镜成像数据的工具，重点是跟踪流动的血细胞。它指导从分割到特征计算的步骤，过滤颗粒不感兴趣，还提供了一组公用事业，以帮助检查执行的操作质量（例如，分割的良好程度）。它允许研究跟踪流动细胞（例如血管中）的问题，可以将流动，滚动和粘附的颗粒分类。这种分类应用于止血和血栓形成研究等现象的研究。此外，FlowCatchr基于与闪亮的应用程序和jupyter笔记本电脑的集成，它与包装一起交付，并可以在R环境中启用完全可重现的生物图像分析。

作者：费德里科·马里尼（Federico Marini）[AUT，CRE]

维护者：uni-mainz.de>的Federico Marini

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ flowcatchr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ flowcatchr”）

html	R脚本	FlowCatchr：时间流逝显微镜图像中的跟踪和分析细胞
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	细胞生物学，，，，分类，，，，GUI，，，，基础设施，，，，软件，，，，可视化
版本	1.18.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（5年）
执照	BSD_3_Clause +文件许可证
要看	R（> = 2.10），方法，ebimage
进口	柱面，，，，艾宾，，，，生物比较，图形，统计，utils，情节，，，，闪亮的
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求	成像
增强
URL	https://github.com/federicomarini/flowcatchrhttps://federicomarini.github.io/flowcatchr/
BugReports	https://github.com/federicomarini/flowcatchr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	FlowCatchr_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	FlowCatchr_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	FlowCatchr_1.18.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowcatchr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/flowcatchr
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowcatchr/
软件包下载报告	下载统计