农场

DOI:10.18129 / B9.bioc.farms

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见农场

农场-因子分析稳健的微阵列总结

Bioconductor版本:3.9

该软件包提供了一种名为“健壮微阵列摘要(FARMS)的因子分析”的摘要算法和一种名为“I/NI-calls”的新型无监督特征选择准则。

作者:Djork-Arne Clevert

维护者:Djork-Arne Clevert

引文(从R内,输入引用(“农场”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("farms")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“农场”)

PDF R脚本 使用农场
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneExpression微阵列预处理质量控制软件
版本 1.36.0
在Bioconductor BioC 2.7 (R-2.12)(9年)
许可证 LGPL (>= 2.1)
取决于 R (>= 2.8),affy(> = 1.20.0),质量、方法
进口 affy质量Biobase(>= 1.13.41),方法,图形
链接
建议 affydataBiobase,跑龙套
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bioinf.jku.at/software/farms/farms.html
全靠我
进口我
建议我 DEqMS
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 farms_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 farms_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) farms_1.36.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/farms
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/farms
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/farms/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网