外表

doi：10.18129/b9.bioc.exomepeak

该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅外表。

Merip-Seq数据的基于外显子的Anlaysis：峰值通话和差分分析

生物导体版本：3.9

该软件包的开发用于分析Merip-Seq（MAA-Seq）的基于亲和力的表演组简短测序数据。它是基于Exomepeak Matlab软件包（Meng，Jia等。“基于外显子的分析RNA表观基因组测序数据。” Bioinformatics 29.12（2013）（2013）：1565-1567。实验条件以揭示RNA甲基甲基转录后调节的动力学。外峰R包装接受并在统计学上支持多种生物学重复，内部删除PCR伪像和多映射读取，输出基于外显子组的结合位点（RNA甲基化位点）检测不同的转录后RNA修饰位点的不同实验条件，百分比而不是绝对数量。该软件包仍在积极发展中，我们欢迎所有生物学和计算科学家进行各种合作和沟通。请随时与Jia Meng博士联系 如果你有任何问题。

作者：lin Zhang ，lian liu ，jia meng

维护者：lin Zhang ，lian liu ，jia meng

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ exomeomepeak”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ ExomeOmepeak”）

PDF	R脚本	外峰介绍
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	高通量序列，，，，甲基，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件
版本	2.17.0
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（6年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 3.5.0），rsamtools，，，，GenomicFeatures（> = 1.14.5），rtracklayer，，，，基因组签名
进口
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	exomepeak_2.17.0.tar.gz
Windows二进制	exomepeak_2.17.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	exomepeak_2.17.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/exomepeak
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/exomeomepeak
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/exomepeak/
软件包下载报告	下载统计