epivizr

doi：10.18129/b9.bioc.epivizr

该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅epivizr。

R接口到Epiviz Web应用程序

生物导体版本：3.9

该软件包提供了与Epiviz Web应用程序（http://epiviz.cbcb.umd.edu）的连接，用于基因组数据的交互式可视化。R/Bioc交互式会话中的对象可以显示在基因组浏览器轨道或图中，可以通过基因组区域进行导航探索。支持基本的生物导体数据结构（例如，基因组和远程符号特性对象），同时提供了一种简单的机制来支持其他数据结构（通过包装epivizrdata）。可视化（使用d3.js）也可以轻松地添加到Web应用程序中。

作者：Hector Corrada Bravo，Florin Chelaru，Llewellyn Smith，Naomi Goldstein，Jayaram Kancherla，Morgan Walter，Brian Gottfried

维护者：hector Corrada bravo

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ epivizr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ epivizr”）

html	R脚本	Epivizr简介
PDF		参考手册
文本		消息
视频		eviviz快速旅行

细节

生物浏览	GUI，，，，基础设施，，，，软件，，，，可视化
版本	2.14.0
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（6年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.0），方法
进口	Epivizrserver（> = 1.1.1），epivizrdata（> = 1.3.4），基因组机，，，，S4VECTORS，，，，iranges
链接
建议	测试，，，，roxygen2，，，，尼特，，，，生物酶，，，，总结性特征，，，，抗fofilesdata，，，，hgu133plus2.db，，，，mus.musculus，，，，生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我	EPIVIZRSTANTALLONE
进口我	metavizr
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	epivizr_2.14.0.tar.gz
Windows二进制	epivizr_2.14.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	epivizr_2.14.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/epivizr
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/epivizr/
软件包下载报告	下载统计