该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅富集。
生物导体版本:3.9
“富集”软件包实现了几种可视化方法,以解释从ORA或GSEA分析获得的功能富集结果。所有可视化方法都是基于“ GGPLOT2”图形开发的。
维护者:gmail.com> guangchuang yu
引用(从r内,输入引用(“富集”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ enrichplot”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“富集”)
html | 富集 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,去,,,,基因烯,,,,kegg,,,,途径,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(1。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.4.0) |
进口 | AnnotationDbi,,,,牛仔图,,,,剂量(> = 3.5.1),EUROPEPMC,,,,GGPLOT2,,,,ggplotify,,,,ggraph,,,,Ggridges,,,,Gosemsim,图形,grdevices,网格,栅格,,,,Igraph, 方法,purrr,,,,rcolorbrewer,,,,RESHAPE2,统计insctr,UTILS |
链接 | |
建议 | clusterProfiler,,,,dplyr,,,,尼特,,,,org.hs.eg.db,,,,Prettydoc |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/guangchuangyu/enrichplot |
BugReports | https://github.com/guangchuangyu/enrichplot/issues |
取决于我 | |
进口我 | Chipseeker,,,,clusterProfiler,,,,碎片器,,,,网眼,,,,Reactomepa |
建议我 | 甲基 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | enrichplot_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | enrichplot_1.4.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | enrichplot_1.4.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enrichplot |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/enrichplot |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/enrichplot/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |