富集
doi：10.18129/b9.bioc.enrichtf
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅富集。
转录因子富集分析
生物导体版本：3.9
由于转录因子（TFS）在通过基因组或组合方式上结合转录过程中起着至关重要。尽管通常认为与序列（即基序）具有相似的结合偏好，并且一个TF可能具有多个基序，但TF富集分析比基元富集分析更具挑战性。在这里，我们提出了一个用于TF富集分析的R包，将基序富集与PECA模型相结合。
作者：Zheng Wei，Zhana Duren，Shining MA
维护者：Zheng Wei
引用（从r内，输入引用（“富集”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ enrichtf”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ ronichtf”）
| html | R脚本 | 富集简介 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 遗传学，，，，GraphandNetwork，，，，图案，，，，软件，，，，转录 |
| 版本 | 1.0.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（<6个月） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | 管框 |
| 进口 | BSGENOME，，，，rtracklayer，，，，MotifMatchr，，，，TFBSTOOLS，，，，r.utils， 方法，Jaspar2018，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，iranges，，，，生物基因，，，，S4VECTORS，UTIL，并行，统计 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，马格里特，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/wzthu/enrichtf |
| BugReports | https://github.com/wzthu/enrichtf/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | enrichtf_1.0.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | enrichtf_1.0.0.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | enrichtf_1.0.0.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enrichtf |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/ronichtf |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/enrichtf/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
