这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅derfinderPlot。
Bioconductor版本:3.9
这个包提供了绘图函数结果derfinder包。
作者:达芬奇Collado-Torres (aut (cre)安德鲁·e·贾菲(aut)
黑色,杰弗里·t .韭菜(aut)
维护人员:达芬奇Collado-Torres < lcolladotor gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“derfinderPlot”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“derfinderPlot”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“derfinderPlot”)
HTML | R脚本 | 介绍derfinderPlot |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.18.1 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.2) |
进口 | derfinder(> = 1.1.0),GenomeInfoDb(> = 1.3.3),GenomicFeatures,GenomicRanges(> = 1.17.40),ggbio(> = 1.13.13),ggplot2、图形、grDevicesIRanges(> = 1.99.28),limma、方法、plyr,RColorBrewer,RefManageR,reshape2,S4Vectors(> = 0.9.38),尺度,跑龙套 |
链接 | |
建议 | biovizBase(> = 1.27.2),bumphunter(> = 1.7.6),derfinderData(> = 0.99.0),sessioninfo,knitcitations(> = 1.0.1),knitr(> = 1.6),BiocStyle(> = 2.5.19),org.Hs.eg.db,rmarkdown(> = 0.3.3),testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/leekgroup/derfinderPlot |
BugReports | https://support.bioconductor.org/t/derfinderPlot |
取决于我 | |
进口我 | recountWorkflow |
建议我 | derfinder,regionReport |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | derfinderPlot_1.18.1.tar.gz |
Windows二进制 | derfinderPlot_1.18.1.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | derfinderPlot_1.18.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/derfinderPlot |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ derfinderPlot |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/derfinderPlot/ |
包下载报告 | 下载数据 |